В процессе полимеразной цепной реакции происходит экспоненциальное увеличение количества определенного участка ДНК до количеств, достаточных для детектирования или дальнейшей работы. Эта особенность позволяет выявить наличие единичных молекул ДНК в образце. Однако такая выдающаяся чувствительность является и основным источником проблем. Появление ложноположительных результатов, которые являются результатом загрязнения образца целевым фрагментом ДНК, приводят не только к остановке деятельности лаборатории, но и необходимости повторения уже проведенных анализов, т.е. подрывает доверие к лаборатории.

В процессе полимеразной цепной реакции происходит экспоненциальное увеличение количества определенного участка ДНК до количеств, достаточных для детектирования или дальнейшей работы. Эта особенность позволяет выявить наличие единичных молекул ДНК в образце. Однако такая выдающаяся чувствительность является и основным источником проблем. Появление ложноположительных результатов, которые являются результатом загрязнения образца целевым фрагментом ДНК, приводят не только к остановке деятельности лаборатории, но и необходимости повторения уже проведенных анализов, т.е. подрывает доверие к лаборатории.

Одной из важнейших проблем ПЦР-лаборатории является ее контаминация - загрязнение проб и реактивов целевым фрагментом ДНК. Раннее выявление факта и источника контаминации значительно сокращает потери реактивов и время простоя лаборатории. Однако, лучшим решением является предотвращение контаминации за счет соблюдения правил работы в лаборатории. В основном, меры предосторожности, которые обычно принимаются при обращении с микробиологическими материалы, в равной степени применимы к процедурам, связанным с ПЦР.